系统复制SUMOylation动力学响应应力分析揭示了小说小Ubiquitin-like修改目标蛋白和受体赖氨酸相关的基因组的稳定性。

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肖Z, Chang詹•IA, Sigurethsson乔,奥尔森合资,维提加尔AC

系统复制SUMOylation动力学响应应力分析揭示了小说小Ubiquitin-like修改目标蛋白和受体赖氨酸相关的基因组的稳定性。

摩尔细胞蛋白质组学。2015年5月,14 (5):1419 - 34。doi: 10.1074 / mcp.O114.044792。Epub 2015年3月9日。

PubMed ID

25755297 (在PubMed

]

文摘

基因毒性药物可导致细胞分裂复制叉停滞,因为DNA损伤,最终导致复制叉崩溃时造成的伤害不是修复的。小Ubiquitin-like修饰符(相扑)已知抵消复制压力,然而,只有一小部分相关相扑目标蛋白质是已知的。为了解决这个问题,我们有纯化和鉴定SUMO-2目标蛋白质受压力在人类细胞中复制。发达的方法使单步净化His10-SUMO-2轭合物在变性条件下高产和高纯度。统计分析五个生物复制后,共有566 SUMO-2目标被确定。羟基脲治疗2 h后,10蛋白上调为SUMOylation SUMOylation和两个蛋白质被抑制,而24 h后,和13 35蛋白表达是上调类泛素化蛋白SUMOylation被抑制。特定站点的方法被用来映射超过1000 SUMO-2受体赖氨酸目标蛋白质。的方法是通用的,广泛适用于泛素领域。大子集的确定蛋白质的功能在一个交互网络,包括复制因子,转录监管机构、DNA损伤反应的因素包括MDC1 ATR-interacting蛋白质起锚,布鲁姆综合症蛋白质和BLM-binding伙伴RMI1,交叉结的核酸内切酶EME1, BRCA1和CHAF1A。此外,着丝粒蛋白和信号传感器被SUMOylation在复制动态监管压力。 Our results uncover a comprehensive network of SUMO target proteins dealing with replication damage and provide a framework for detailed understanding of the role of SUMOylation to counteract replication stress. Ultimately, our study reveals how a post-translational modification is able to orchestrate a large variety of different proteins to integrate different nuclear processes with the aim of dealing with the induced DNA damage.

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多肽

的名字	UniProt ID
6月二聚蛋白2	Q8WYK2	细节
PML蛋白	P29590	细节
异构核核糖核蛋白A2 / B1	P22626	细节
异构核L核糖核蛋白	P14866	细节
剪接因子,脯氨酸和多	P23246	细节
异构核核糖核蛋白K	P61978	细节
瑞士/ SNF-related矩阵actin-dependent调节器的染色质亚科1 E成员	Q969G3	细节
增殖细胞核抗原	P12004	细节
Chromobox蛋白质同族体5	P45973	细节
Filamin-A	P21333	细节
Nucleophosmin	P06748	细节
丝氨酸/ arginine-rich剪接因子1	Q07955	细节
可能ATP-dependent RNA解旋酶DDX5	P17844	细节
剪接因子3 b亚基1	O75533	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PRP4同族体	Q13523	细节
ki - 67增殖标记蛋白质	P46013	细节