人类U5 snRNP-specific 100 kd蛋白是一个RS domain-containing,假定的RNA解旋酶和酵母剪接因子Prp28p显著的同源性。
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Teigelkamp年代,Mundt C, Achsel T, CL,鲁曼R
人类U5 snRNP-specific 100 kd蛋白是一个RS domain-containing,假定的RNA解旋酶和酵母剪接因子Prp28p显著的同源性。
RNA。1997年11月,3(11):1313 - 26所示。
- PubMed ID
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9409622 (在PubMed]
- 文摘
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通过UV-crosslinking实验,我们之前提供的证据表明,U5 snRNP蛋白质分子量在100 - kda范围是一种腺苷结合蛋白质(Laggerbauer B,到来J,鲁曼R, 1996年,核酸Res 24:868 - 875)。海拉U5 snRNP分离蛋白质二维凝胶显示多个变体具有明显的分子质量100 kDa。随后microsequencing隔离这些变异导致的cDNA编码一个蛋白质的氨基端RS域和c端域包含所有守恒的图案特征的出局区RNA-stimulated atp酶家族的成员和RNA解旋酶。抗体对cDNA-encoded 100 kda蛋白质特别认可本地U5 - 100 kd在纯化免疫印迹和海拉U5 snRNPs或愉快/ U6。U5 tri-snRNP复合物,确认100 - kda cDNA善意被孤立。体外磷酸化的研究表明,u5 - 100 kd可以作为衬底Clk /猪圈和U1 snRNP-associated激酶,并进一步表明,多个u5 - 100 kd变体观察二维凝胶代表不同蛋白质的磷酸化形式。数据库同源性搜索,他发现一个重要程度的同源性(身份相似度60%,37%)之间的酿酒酵母剪接因子,Prp28p,缺乏一个氨基端RS域,u5 - 100 kd的c端域。符合他们的指定结构同系物,anti-Prp28抗体识别特别是人类u5 - 100 kd蛋白免疫印迹。一起DEXH-box U5 - 200 kd蛋白(EMBO J到来J et al ., 1996 15:4001 - 4015), U5 - 100 kd的第二个例子是一个假定的RNA解旋酶与U5 snRNP紧密关联。鉴于最近的识别U5 - 116 kd蛋白同系物的核糖体移位酶EF-2 (Fabrizio P, Laggerbauer B,到来J,莱恩WS,鲁曼R, 1997年,EMBO J 16:4092 - 4106),至少有三个积分U5 snRNP所以可能会促进蛋白质构象变化的剪接体在核pre-mRNA拼接。