定量phosphoproteomic分析T细胞受体的信号显示系统调制的蛋白质相互作用。

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Mayya V,朗格DH、黄SI Rezaul K, L, Eng JK, Rodionov V,汉族DK

定量phosphoproteomic分析T细胞受体的信号显示系统调制的蛋白质相互作用。

Sci信号。2009年8月18;2 (84):ra46。doi: 10.1126 / scisignal.2000007。

PubMed ID

19690332 (在PubMed

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蛋白质磷酸化事件在T细胞受体(TCR)信号控制形成的复合物在细胞蛋白质近端,激酶级联的激活,激活的转录因子;然而,磷酸化的影响方式和程度在协调有关的各种现象与T细胞的活化作用尚不清楚。因此,我们使用了人类Jurkat T细胞白血病细胞系作为模型系统,进行大规模定量phosphoproteomic分析识别信号。我们确认10665独特的磷酸化站点,其中696显示TCR-responsive变化。此外,我们磷酸化的广泛趋势的数据集进行分析,以发现潜在机制与T细胞活化相关。我们发现,刺激细胞,参与广泛目标蛋白质磷酸化事件模块的所有凸现象与T细胞激活:模式的表面蛋白,细胞的内吞作用,形成的f -肌动蛋白杯,由内而外的激活蛋白微管的两极分化,细胞因子的生产,和信使RNA的可变剪接。此外,个案分析TCR-responsive蛋白质磷酸化网站属于相关功能模块与网络分析使我们能够推断出serine-threonine (s - t)磷酸化调节蛋白质-蛋白质之间的关系(质子泵抑制剂)系统的方式。我们还提供实验支持这种推理表明质子泵抑制剂在六个不同的微管蛋白的磷酸化丝氨酸残基废除在微管的组装。我们建议调制的质子泵抑制剂stimulus-dependent s - t磷酸化状态的变化是一个普遍现象,适用于许多其他的信号系统。

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多肽

的名字	UniProt ID
压敏电阻器衣架钙通道亚基alpha-1I	Q9P0X4	细节
酪氨酸受体激酶ABL1	P00519	细节
NADH脱氢酶(辅酶q)黄素蛋白3,线粒体	P56181	细节
7-dehydrocholesterol还原酶	Q9UBM7	细节
英国皇家空军原癌基因丝氨酸/ threonine-protein激酶	P04049	细节
转酮醇酶	P29401	细节
凝血因子V	P12259	细节
L-lactate脱氢酶B链	P07195	细节
丙酮酸激酶11	P14618	细节
电压门控钾通道亚科2 H成员	Q12809	细节
溶质载体家庭22个成员5	O76082	细节
溶质载体家庭12成员6	Q9UHW9	细节
DNA连接酶3	P49916	细节
双官能谷氨酸/脯氨酸——tRNA连接酶	P07814	细节
DNA连接酶1	P18858	细节
中性氨基酸转运蛋白B (0)	Q15758	细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶亚基beta 1	Q9Y478	细节
t细胞表面糖蛋白CD3ε链	P07766	细节
溶质载体家庭12成员7	Q9Y666	细节
GMP合成酶(glutamine-hydrolyzing)	P49915	细节
Thymidylate合酶	P04818	细节
过氧化物酶病多功能酶2型	P51659	细节
钙调蛋白	P0DP23	细节
L-lactate脱氢酶连锁	P00338	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶A-Raf	P10398	细节
Abelson酪氨酸受体激酶2	P42684	细节
中性氨基酸转运蛋白	P43007	细节
血清白蛋白	P02768	细节
Chromodomain-helicase-DNA-binding蛋白1	O14646	细节
Glyceraldehyde-3-phosphate脱氢酶	P04406	细节
DNA聚合酶α催化亚基	P09884	细节
整合素alpha 4	P13612	细节
溶质载体家庭12成员4	Q9UP95	细节
Choline-phosphate cytidylyltransferase一	P49585	细节
乙酰辅酶a羧化酶1	Q13085	细节
cAMP-specific 3 ', 5 '环磷酸二酯酶7 b	Q9NP56	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶b - raf	P15056	细节
NADH-ubiquinone链氧化还原酶2	P03891	细节
干扰素α/β受体1	P17181	细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶催化亚基alpha -	Q13131	细节
DNA聚合酶α亚基B	Q14181	细节
钠/ potassium-transporting atp酶亚基alpha -	P05023	细节
胆绿素还原酶一	P53004	细节
DNA拓扑异构酶2α	P11388	细节
/钠氢交换器1	P19634	细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶亚基beta 2	O43741	细节
Sphingosine-1-phosphate裂合酶1	O95470	细节
苹果酸脱氢酶、线粒体	P40926	细节
耐多药resistance-associated蛋白1	P33527	细节
糖皮质激素受体	P04150	细节
原癌基因酪氨酸受体激酶Src	P12931	细节
酪氨酸受体激酶Lck	P06239	细节
CTP合酶1	P17812	细节
组蛋白脱乙酰酶9	Q9UKV0	细节
信号传感器和激活转录5 b	P51692	细节
DNA甲基转移酶1 (cytosine-5)	P26358	细节
生长因子receptor-bound蛋白2	P62993	细节
增殖蛋白激酶1	P28482	细节
磷脂酰肌醇3-kinase调节亚基α	P27986	细节
循环AMP-responsive元件结合蛋白1	P16220	细节
胰岛素受体底物1	P35568	细节
连环蛋白beta 1	P35222	细节
Thiopurine S-methyltransferase	P51580	细节
突触囊泡糖蛋白2 a	Q7L0J3	细节
Phospholipid-transporting腺苷三磷酸酶IA	Q9Y2Q0	细节
E3 ubiquitin-protein连接酶Mdm2	Q00987	细节
Calnexin	P27824	细节
Rho-associated蛋白激酶1	Q13464	细节
增殖蛋白激酶14	Q16539	细节
转录因子AP-1	P05412	细节
三磷酸鸟苷cyclohydrolase 1	P30793	细节
增殖蛋白激酶3	P27361	细节
糖原合成酶激酶3β	P49841	细节
酪氨酸受体磷酸酶non-receptor类型11	Q06124	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶2	P24941	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶1	P06493	细节
核因子NF-kappa-B施敏原著亚基	P19838	细节
CD44抗原	P16070	细节
热休克蛋白HSP 90 -α	P07900	细节
原癌基因c-Fos	P01100	细节
蛋白激酶Cα型	P17252	细节
cAMP-specific 3 ', 5 '环磷酸二酯酶4 a	P27815	细节
肌醇monophosphatase 1	P29218	细节
核因子抑制剂kappa-B激酶β亚基	O14920	细节
Microtubule-associated蛋白1	P78559	细节
RAC-beta丝氨酸/ threonine-protein激酶	P31751	细节
14-3-3蛋白ζ/δ	P63104	细节
Phosphatidylethanolamine-binding蛋白1	P30086	细节
耐多药resistance-associated蛋白4	O15439	细节
3-phosphoinositide-dependent蛋白激酶1	O15530	细节
Glucose-6-phosphate异构酶	P06744	细节
Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E	Q08188	细节
酪氨酸受体激酶zap - 70	P43403	细节
酪氨酸受体激酶麦克米兰	P43405	细节
酪氨酸受体激酶ITK /啧啧	Q08881	细节
蛋白激酶Cθ类型	Q04759	细节
微管蛋白alpha-1C链	Q9BQE3	细节
DNA修复蛋白XRCC4	Q13426	细节
Fructose-bisphosphate醛缩酶一	P04075	细节
有丝分裂期诱导物磷酸酶2	P30305	细节
保利(ADP-ribose)聚合酶1	P09874	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶7	P50613	细节
硫氧还蛋白还原酶1,细胞质	Q16881	细节
细胞因子受体常见的亚基γ	P31785	细节
层粘连蛋白亚基alpha-5	O15230	细节
Retinoblastoma-associated蛋白质	P06400	细节
Methylmalonic酸尿和C型高胱氨酸尿蛋白	Q9Y4U1	细节
蛋氨酸adenosyltransferase 2β亚基	Q9NZL9	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶6	Q00534	细节
腺苷脱氨酶	P00813	细节
多功能蛋白ADE2	P22234	细节
CAD蛋白质	P27708	细节
Phosphoribosylformylglycinamidine合酶	O15067	细节
N-acetyl-D-glucosamine激酶	Q9UJ70	细节
Peptidyl-prolyl顺反异构酶G	Q13427	细节
组蛋白脱乙酰酶1	Q13547	细节
组蛋白脱乙酰酶2	Q92769	细节
组蛋白脱乙酰酶3	O15379	细节
磷脂酰肌醇3-kinase调节亚基β	O00459	细节
依赖dna的蛋白激酶催化亚基	P78527	细节
蛋白激酶C三角洲类型	Q05655	细节
DNA拓扑异构酶2β	Q02880	细节
Ribonucleoside-diphosphate还原酶亚基平方米	P31350	细节
E3 ubiquitin-protein连接酶UBR4	Q5T4S7	细节
NAD-dependent蛋白脱乙酰酶sirtuin-1	Q96EB6	细节
Telomerase-binding蛋白质EST1A	Q86US8	细节
前列腺素E合酶3	Q15185	细节
Wiskott-Aldrich综合症蛋白质	P42768	细节
Gephyrin	Q9NQX3	细节
炭疽毒素受体2	P58335	细节
Pleckstrin同源domain-containing家庭成员1	Q9HB21	细节
酪蛋白激酶gamma-2。我对碘氧基苯甲醚	P78368	细节
Wee1-like蛋白激酶	P30291	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Chk1	O14757	细节
微管蛋白beta-6链	Q9BUF5	细节
Bcl-2-like蛋白2	Q92843	细节
Bcl2-associated受体激动剂的细胞死亡	Q92934	细节
目前上游元件结合蛋白1	Q96AE4	细节
cAMP-dependent蛋白激酶类型II-alpha调节亚基	P13861	细节
cAMP-dependent蛋白激酶类型一调节亚基	P10644	细节
t细胞表面糖蛋白CD3三角洲链	P04234	细节
t细胞表面糖蛋白CD3γ链	P09693	细节
t细胞表面糖蛋白CD3ζ链	P20963	细节
Microtubule-associated蛋白4	P27816	细节
肌质/内质网钙atp酶2	P16615	细节
肿瘤坏死因子受体超家族成员8	P28908	细节
酪氨酸受体激酶JAK3	P52333	细节
跨膜转换前后蛋白质1同族体	Q6NXT6	细节
酪蛋白激酶我同种型ε	P49674	细节
热休克因子1的蛋白质	Q00613	细节
组蛋白脱乙酰酶4	P56524	细节
组蛋白脱乙酰酶7	Q8WUI4	细节
双3 ',5 '环腺苷酸和gmp磷酸二酯酶11	Q9HCR9	细节
血清paraoxonase /内酯酶3	Q15166	细节
Receptor-type酪氨酸受体磷酸酶ε	P23469	细节
整合素beta 1	P05556	细节
Nischarin	Q9Y2I1	细节
Cation-independent mannose-6-phosphate受体	P11717	细节
Copper-transporting atp酶1	Q04656	细节
核受体共激活剂2	Q15596	细节
cAMP-dependent蛋白激酶催化亚基α	P17612	细节
Uracil-DNA糖基化酶	P13051	细节
热休克蛋白质同源71 kDa	P11142	细节
双特异性蛋白激酶TTK	P33981	细节
Endothelin-converting酶1	P42892	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶haspin	Q8TF76	细节
内心的着丝粒蛋白	Q9NQS7	细节
60年代L37核糖体蛋白质	P61927	细节
Triosephosphate异构酶	P60174	细节
蛋白激酶C极微小的类型	P41743	细节
蛋白酶体亚基α2型	P25787	细节
蛋白酶体亚基α3型脊髓灰质炎病毒引起	P25788	细节
蛋白酶体亚基α5型	P28066	细节
双特异性tyrosine-phosphorylation-regulated激酶1	Q13627	细节
STE20-like丝氨酸/ threonine-protein激酶	Q9H2G2	细节
钙/ calmodulin-dependent蛋白激酶IV型	Q16566	细节
双特异性蛋白激酶CLK3	P49761	细节
核受体共激活剂5	Q9HCD5	细节
Hydroxymethylglutaryl-CoA合酶,胞质	Q01581	细节
钙/ calmodulin-dependent蛋白激酶II型亚基三角洲	Q13557	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶26	Q9P289	细节
Profilin-1	P07737	细节
MKL / myocardin-like蛋白1	Q969V6	细节
Cofilin-1	P23528	细节
Rho-associated蛋白激酶2	O75116	细节
Actin-related 2/3复杂蛋白质亚基1 b	O15143	细节
Actin-related蛋白质2/3复杂的亚基3	O15145	细节
SRSF蛋白激酶2	P78362	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶17 b	O94768	细节
Afadin	P55196	细节
Interleukin-1 receptor-associated激酶4	Q9NWZ3	细节
CREB-binding蛋白质	Q92793	细节
中介的RNA聚合酶II转录单元1	Q15648	细节
蛋白质精氨酸N-methyltransferase 3	O60678	细节
Epsin-1	Q9Y6I3	细节
Phosphoglucomutase-1	P36871	细节
波形蛋白	P08670	细节
cAMP-dependent蛋白激酶催化β亚基	P22694	细节
Ras-related蛋白质Rab-8B	Q92930	细节
cAMP-dependent蛋白激酶类型II-beta调节亚基	P31323	细节
保利(A)聚合酶α	P51003	细节
3-ketoacyl-CoA硫解酶,过氧化物酶病	P09110	细节
NAD-dependent蛋白脱乙酰酶sirtuin-3,线粒体	Q9NTG7	细节
T-complex蛋白质1亚基γ	P49368	细节
羧肽酶D	O75976	细节
过渡内质网腺苷三磷酸酶	P55072	细节
Ubiquitin-like modifier-activating酶1	P22314	细节
组蛋白乙酰转移酶KAT5	Q92993	细节
瑞士/ SNF-related矩阵actin-dependent调节器的染色质亚科5一员	O60264	细节
Uridine-cytidine kinase-like 1	Q9NWZ5	细节
血影蛋白β链,non-erythrocytic 1	Q01082	细节
Kinesin-like蛋白质KIF2C	Q99661	细节
乙酰胆碱受体α亚基	P02708	细节
碳酸氢钠转运蛋白3	Q9Y6M7	细节
断点集群地区蛋白质	P11274	细节
双特异性增殖蛋白激酶激酶2	P36507	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶2	Q9Y2U5	细节
RalA-binding蛋白1	Q15311	细节
5 (3)-deoxyribonucleotidase,胞质类型	Q8TCD5	细节
转铁蛋白受体蛋白1	P02786	细节
核糖体蛋白S6激酶alpha 3	P51812	细节
膜相关组件1孕激素受体	O00264	细节
肌醇1,4,5-trisphosphate受体类型3	Q14573	细节
循环AMP-dependent ATF-1转录因子	P18846	细节
循环AMP-dependent ATF-2转录因子	P15336	细节
补充组件1 Q subcomponent-binding蛋白质,线粒体	Q07021	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶MLT	Q9NYL2	细节
Alpha-enolase	P06733	细节
PML蛋白	P29590	细节
核仁的和coiled-body磷蛋白质1	Q14978	细节
TGF-beta-activated激酶1和MAP3K7-binding蛋白质1	Q15750	细节
蛋白质O-GlcNAcase	O60502	细节
拉到	P46939	细节
Nucleobindin-2	P80303	细节
Calmodulin-2	P0DP24	细节
Calmodulin-3	P0DP25	细节
60 kDa热休克蛋白、线粒体	P10809	细节
40年代核糖体蛋白S2	P15880	细节
异构核核糖核蛋白A2 / B1	P22626	细节
异构核核糖核蛋白H	P31943	细节
异构核核糖核蛋白H3	P31942	细节
剪接因子,脯氨酸和多	P23246	细节
真核翻译起始因子6	P56537	细节
14-3-3蛋白β/α	P31946	细节
Hepatoma-derived生长因子	P51858	细节
磷酸甘油酸酯变位酶1	P18669	细节
Ran-specific GTPase-activating蛋白质	P43487	细节
蛋白质disulfide-isomerase A3	P30101	细节
磷脂酰肌醇4-kinase类型2β	Q8TCG2	细节
杭丁顿蛋白	P42858	细节
淋巴enhancer-binding因子1	Q9UJU2	细节
真核翻译起始因子3单元F	O00303	细节
异构核核糖核蛋白K	P61978	细节
70 kDa热休克蛋白4	P34932	细节
剪接因子3单元3	Q12874	细节
瑞士/ SNF-related矩阵actin-dependent调节器的染色质亚科1 E成员	Q969G3	细节
肿瘤蛋白质D54	O43399	细节
泛素羧基末端水解酶14	P54578	细节
14-3-3蛋白埃塔	Q04917	细节
14-3-3蛋白θ	P27348	细节
Chromobox蛋白质同族体5	P45973	细节
角蛋白,II型细胞骨架1	P04264	细节
Desmoplakin	P15924	细节
Hornerin	Q86YZ3	细节
KAT8监管NSL复杂的亚基3	Q9P2N6	细节
目前上游元件结合蛋白2	Q92945	细节
半胱氨酸和glycine-rich蛋白质1	P21291	细节
Filamin-A	P21333	细节
异构核核糖核蛋白D0	Q14103	细节
异染色质蛋白质1-binding 3	Q5SSJ5	细节
Nucleophosmin	P06748	细节
60年代L14核糖体蛋白质	P50914	细节
40年代核糖体蛋白肌力	P08708	细节
40年代S8核糖体蛋白质	P62241	细节
剪接因子1	Q15637	细节
Transgelin-2	P37802	细节
Zyxin	Q15942	细节
生存运动神经元蛋白质	B4DP61	细节
Myosin-9	P35579	细节
剪接因子3 b亚基1	O75533	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶3	Q13188	细节
酪氨酸受体激酶Tec	P42680	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶38	Q15208	细节
STE20 / SPS1-related proline-alanine-rich蛋白激酶	Q9UEW8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO1	Q7L7X3	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶tousled-like 1	Q9UKI8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶tousled-like 2	Q86UE8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶ULK1	O75385	细节
AP2-associated蛋白激酶1	Q2M2I8	细节
BMP-2-inducible蛋白激酶	Q9NSY1	细节
Citron Rho-interacting激酶	O14578	细节
干扰素诱导,双链RNA-activated蛋白激酶	P19525	细节
Cyclin-G-associated激酶	O14976	细节
糖原合成酶激酶3α	P49840	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶SIK3	Q9Y2K2	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶LATS1	O95835	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶10	Q02779	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶11	Q16584	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶12	Q12852	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶3	Q99759	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶4	Q9Y6R4	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶激酶1	Q92918	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶激酶2	Q12851	细节
增殖蛋白激酶激酶激酶激酶4	O95819	细节
地图kinase-activated蛋白激酶5	Q8IW41	细节
地图/微管affinity-regulating激酶3	P27448	细节
CLIP-associating蛋白1	Q7Z460	细节
Megakaryocyte-associated酪氨酸受体激酶	P42679	细节
母体胚胎亮氨酸拉链激酶	Q14680	细节
Misshapen-like激酶1	Q8N4C8	细节
地图kinase-interacting丝氨酸/ threonine-protein激酶2	Q9HBH9	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Nek4	P51957	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Nek9	Q8TD19	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶OSR1	O95747	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PAK 1	Q13153	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PAK 2	Q13177	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PAK 4	O96013	细节
细胞周期蛋白依赖性激酶17	Q00537	细节
磷脂酰肌醇4-kinaseβ	Q9UBF8	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶N1	Q16512	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶N2	Q16513	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PRP4同族体	Q13523	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶RIO1	Q9BRS2	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶RIO2	Q9BVS4	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶SIK2	Q9H0K1	细节
SNF-related丝氨酸/ threonine-protein激酶	Q9NRH2	细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶10	O94804	细节
Histone-lysine N-methyltransferase EZH2	Q15910	细节
磷酸甘油酸酯激酶2	P07205	细节
增殖蛋白激酶6	Q16659	细节
NAD-dependent蛋白脱乙酰酶sirtuin-2	Q8IXJ6	细节
Sulfotransferase 4 a1	Q9BR01	细节
电压门控钾离子通道亚基beta 2	Q13303	细节
细胞色素b还原酶1	Q53TN4	细节
atp柠檬酸合酶	P53396	细节
溶质载体家庭23个成员2	Q9UGH3	细节
Sodium-coupled中性氨基酸转运蛋白2	Q96QD8	细节
锌转运体zip2	Q9BRY0	细节
酪氨酸受体磷酸酶non-receptor类型6	P29350	细节
Molybdopterin合酶催化亚基	O96007	细节
真核翻译起始因子4 e结合蛋白1	Q13541	细节
1-phosphatidylinositol 4, 5-bisphosphate磷酸二酯酶gamma-2	P16885	细节
Lysine-specific组蛋白demethylase 1	O60341	细节
信号传感器和转录激活1α/β	P42224	细节
ki - 67增殖标记蛋白质	P46013	细节
G1 / S-specific cyclin-D3	P30281	细节
组蛋白乙酰转移酶p300	Q09472	细节
ELAV-like蛋白1	Q15717	细节
cAMP-dependent蛋白激酶iβ型调节亚基	P31321	细节
Bcl-2-like蛋白11	O43521	细节