定量phosphoproteomics揭示广泛的全面磷酸化网站入住率在有丝分裂期间。

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奥尔森合资,Vermeulen M, Santamaria Kumar C,米勒ML,詹森LJ Gnad F,考克斯J,詹森TS Nigg EA,椰子饼年代,曼M

定量phosphoproteomics揭示广泛的全面磷酸化网站入住率在有丝分裂期间。

Sci信号。2010年1月12日,3 (104):ra3中。doi: 10.1126 / scisignal.2000475。

PubMed ID
20068231 (在PubMed
]
文摘

真核细胞复制通过一系列复杂的进化事件的严格监管定义阶段的细胞分裂周期。进程通过这个循环涉及大量的专用蛋白质复合物和信号通路,与肿瘤发生和放松管制的过程。我们应用高分辨率的大规模研究蛋白质组和磷酸化蛋白质组spectrometry-based蛋白质组学在全球范围内人类细胞周期和量化的6027和20443独特的磷酸化蛋白质网站及其动力学。粘住蛋白质和磷酸化网站分组根据他们的细胞周期动力学和相对于公开信使核糖核酸微阵列数据。大多数检测磷酸化网站和超过20%的所有量化蛋白质显示大量的监管,主要发生在有丝分裂细胞。Kinase-motif分析显示全球激活在S期的DNA损伤反应网络,由ATM由磷酸化或ATR或依赖DNA的蛋白激酶。我们确定特定站点的化学计量学5000多个网站和发现,大多数网站由细胞周期蛋白依赖性激酶磷酸化表达的上调1 (CDK1)或CDK2几乎完全是在有丝分裂细胞磷酸化。特别是核蛋白质和蛋白质参与调节代谢过程有很高的磷酸化网站在有丝分裂入住率。这表明,这些蛋白质磷酸化可能灭活的有丝分裂细胞。

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的名字 UniProt ID
NADH脱氢酶(辅酶q)黄素蛋白3,线粒体 P56181 细节
7-dehydrocholesterol还原酶 Q9UBM7 细节
英国皇家空军原癌基因丝氨酸/ threonine-protein激酶 P04049 细节
转酮醇酶 P29401 细节
L-lactate脱氢酶B链 P07195 细节
肌酸激酶b型 P12277 细节
丙酮酸激酶11 P14618 细节
L-lactate脱氢酶C链 P07864 细节
谷氨酸,半胱氨酸连接酶催化亚基 P48506 细节
DNA连接酶3 P49916 细节
肉碱O-palmitoyltransferase 2,线粒体 P23786 细节
双官能谷氨酸/脯氨酸——tRNA连接酶 P07814 细节
DNA连接酶1 P18858 细节
中性氨基酸转运体大小亚基1 Q01650 细节
Pyrroline-5-carboxylate还原酶1,线粒体 P32322 细节
色氨酸——tRNA连接酶,胞质 P23381 细节
中性氨基酸转运蛋白B (0) Q15758 细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶亚基beta 1 Q9Y478 细节
beta 1, 4-galactosyltransferase 1 P15291 细节
丙氨酸——tRNA连接酶,胞质 P49588 细节
GMP合成酶(glutamine-hydrolyzing) P49915 细节
Acetyl-coenzyme合成酶,细胞质 Q9NR19 细节
钠和chloride-dependent肌酸转运体1 P48029 细节
铁蛋白重链 P02794 细节
视黄酸受体RXR-alpha P19793 细节
膜联蛋白A1 P04083 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶A-Raf P10398 细节
Abelson酪氨酸受体激酶2 P42684 细节
Monocarboxylate运输车4 O15427 细节
中性氨基酸转运蛋白 P43007 细节
异亮氨酸tRNA连接酶,胞质 P41252 细节
受体酪氨酸受体激酶erbB-2 P04626 细节
天门冬氨酰/ asparaginyl beta-hydroxylase Q12797 细节
Chromodomain-helicase-DNA-binding蛋白1 O14646 细节
Glyceraldehyde-3-phosphate脱氢酶 P04406 细节
蛋氨酸tRNA连接酶,胞质 P56192 细节
DNA聚合酶α催化亚基 P09884 细节
阳离子氨基酸转运蛋白2 P52569 细节
丙酮酸脱氢酶α亚基E1组件,躯体形式,线粒体 P08559 细节
苹果酸脱氢酶,胞质 P40925 细节
溶质载体家庭12成员4 Q9UP95 细节
天冬酰胺tRNA连接酶,胞质 O43776 细节
Choline-phosphate cytidylyltransferase一 P49585 细节
酪氨酸受体磷酸酶non-receptor 1型 P18031 细节
乙酰辅酶a羧化酶1 Q13085 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶b - raf P15056 细节
UDP-glucose 6-dehydrogenase O60701 细节
胞质磷脂酶A2 P47712 细节
Monocarboxylate转运体1 P53985 细节
Argininosuccinate合酶 P00966 细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶催化亚基alpha - Q13131 细节
视黄段蛋白3 Q8NFJ5 细节
半胱氨酸- tRNA连接酶,胞质 P49589 细节
DNA聚合酶α亚基B Q14181 细节
Inosine-5”一磷酸脱氢酶2 P12268 细节
Pyrroline-5-carboxylate还原酶2 Q96C36 细节
血红素加氧酶1 P09601 细节
DNA拓扑异构酶2α P11388 细节
/钠氢交换器1 P19634 细节
血栓素A2受体 P21731 细节
蛋氨酸合成酶还原酶 Q9UBK8 细节
表皮生长因子受体 P00533 细节
5 ' -AMP-activated蛋白激酶亚基beta 2 O43741 细节
Sphingosine-1-phosphate裂合酶1 O95470 细节
耐多药resistance-associated蛋白1 P33527 细节
糖皮质激素受体 P04150 细节
酪氨酸受体激酶菲英岛 P06241 细节
Ephrin a受体2 P29317 细节
Perilipin-3 O60664 细节
胰岛素样生长因子1受体 P08069 细节
CTP合酶1 P17812 细节
信号传感器和激活转录5 b P51692 细节
DNA甲基转移酶1 (cytosine-5) P26358 细节
Calpastatin P20810 细节
C-X-C趋化因子受体类型4 P61073 细节
增殖蛋白激酶1 P28482 细节
脂肪酸合酶 P49327 细节
DNA拓扑异构酶1 P11387 细节
连环蛋白beta 1 P35222 细节
Calnexin P27824 细节
Peptidyl-prolyl顺反异构酶一 P62937 细节
增殖蛋白激酶14 Q16539 细节
转录因子AP-1 P05412 细节
Proton-coupled叶酸运输车 Q96NT5 细节
溶质载体家庭2,促进葡萄糖转运体1成员 P11166 细节
增殖蛋白激酶3 P27361 细节
糖原合成酶激酶3β P49841 细节
微管的multispecific有机阴离子转运体1 Q92887 细节
酪氨酸受体磷酸酶non-receptor类型11 Q06124 细节
细胞周期蛋白依赖性激酶1 P06493 细节
细胞间粘附分子1 P05362 细节
78 kDa glucose-regulated蛋白质 P11021 细节
磷脂酰丝氨酸合酶1 P48651 细节
CD44抗原 P16070 细节
热休克蛋白HSP 90 -α P07900 细节
蛋白激酶Cα型 P17252 细节
Deoxyhypusine合酶 P49366 细节
核因子抑制剂kappa-B激酶β亚基 O14920 细节
Endoplasmin P14625 细节
Microtubule-associated蛋白1 P78559 细节
14-3-3蛋白ζ/δ P63104 细节
Phosphatidylethanolamine-binding蛋白1 P30086 细节
耐多药resistance-associated蛋白4 O15439 细节
囊性纤维化跨膜电导调节 P13569 细节
脱氧尿苷5 '三磷酸nucleotidohydrolase,线粒体 P33316 细节
酪蛋白激酶ⅱα亚基 P68400 细节
胸苷激酶,胞质 P04183 细节
cAMP-specific 3 ', 5 '环磷酸二酯酶4 d Q08499 细节
微管蛋白alpha-1C链 Q9BQE3 细节
甲硫氨酸氨肽酶2 P50579 细节
DNA修复蛋白XRCC4 Q13426 细节
Fructose-bisphosphate醛缩酶一 P04075 细节
Ras-related蛋白质Rab-9A P51151 细节
保利(ADP-ribose)聚合酶1 P09874 细节
早期内体抗原1 Q15075 细节
Kinesin-like蛋白质KIF11 P52732 细节
热休克蛋白HSP 90 -β P08238 细节
细胞周期蛋白依赖性激酶7 P50613 细节
ADP-ribose焦磷酸酶,线粒体 Q9BW91 细节
角蛋白,II型细胞骨架8 P05787 细节
Retinoblastoma-associated蛋白质 P06400 细节
Pyridoxal-dependent脱羧酶domain-containing蛋白质1 Q6P996 细节
钼辅因子sulfurase Q96EN8 细节
Methylmalonic酸尿和C型高胱氨酸尿蛋白 Q9Y4U1 细节
胆碱/ ethanolaminephosphotransferase 1 Q9Y6K0 细节
Egl九同族体1 Q9GZT9 细节
多功能蛋白ADE2 P22234 细节
CAD蛋白质 P27708 细节
Phosphoribosylformylglycinamidine合酶 O15067 细节
琥珀酰辅酶:3-ketoacid辅酶A转移酶1,线粒体 P55809 细节
N-acetyl-D-glucosamine激酶 Q9UJ70 细节
磷脂酰丝氨酸合酶2 Q9BVG9 细节
视黄醇脱氢酶14 Q9HBH5 细节
Peptidyl-prolyl顺反异构酶G Q13427 细节
蛋白酶体亚基β2型 P49721 细节
组蛋白脱乙酰酶1 Q13547 细节
组蛋白脱乙酰酶2 Q92769 细节
蛋白质治疗/ geranylgeranyltransferase 1型α亚基 P49354 细节
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核因子NF-kappa-B p100亚基 Q00653 细节
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蛋白激酶C三角洲类型 Q05655 细节
DNA拓扑异构酶2β Q02880 细节
Ribonucleoside-diphosphate还原酶亚基平方米 P31350 细节
E3 ubiquitin-protein连接酶UBR4 Q5T4S7 细节
NAD-dependent蛋白脱乙酰酶sirtuin-1 Q96EB6 细节
压敏电阻器anion-selective通道蛋白1 P21796 细节
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氨基端kinase-like蛋白质 Q96KG9 细节
前列腺素E合酶3 Q15185 细节
Gephyrin Q9NQX3 细节
U1小核核糖核蛋白 P09012 细节
蛋白质S100-A11 P31949 细节
脱氧胞苷激酶 P27707 细节
错配修复酶PMS2 P54278 细节
粘着斑激酶1 Q05397 细节
Wee1-like蛋白激酶 P30291 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶Chk1 O14757 细节
极光激酶B Q96GD4 细节
Bcl-2-like蛋白2 Q92843 细节
目前上游元件结合蛋白1 Q96AE4 细节
cAMP-dependent蛋白激酶类型II-alpha调节亚基 P13861 细节
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高迁移率蛋白B1组 P09429 细节
热休克蛋白beta 1 P04792 细节
信号传感器和转录激活3 P40763 细节
Ribosome-binding蛋白1 Q9P2E9 细节
Microtubule-associated蛋白4 P27816 细节
热休克因子1的蛋白质 Q00613 细节
组蛋白脱乙酰酶4 P56524 细节
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Cation-independent mannose-6-phosphate受体 P11717 细节
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溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员4 a1 Q96BD0 细节
Copper-transporting atp酶1 Q04656 细节
高亲和力cAMP-specific IBMX-insensitive 3 ', 5 '环磷酸二酯酶8 O60658 细节
高亲和力cAMP-specific IBMX-insensitive 3 ', 5 '环磷酸二酯酶8 b O95263 细节
核受体共激活剂1 Q15788 细节
鸟嘌呤nucleotide-binding蛋白G (s)α亚基亚型短 P63092 细节
核受体共激活剂2 Q15596 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶PLK1 P53350 细节
Disintegrin和金属蛋白酶domain-containing蛋白17 P78536 细节
s阶段kinase-associated蛋白1 P63208 细节
Uracil-DNA糖基化酶 P13051 细节
袋家族分子伴侣调节器1 Q99933 细节
热休克蛋白质同源71 kDa P11142 细节
双特异性蛋白激酶TTK P33981 细节
内心的着丝粒蛋白 Q9NQS7 细节
丝氨酸/ threonine-protein磷酸酶PP1-alpha催化亚基 P62136 细节
60年代L23a核糖体蛋白质 P62750 细节
60年代L37核糖体蛋白质 P61927 细节
60年代L3核糖体蛋白质 P39023 细节
Triosephosphate异构酶 P60174 细节
胞液氨肽酶 P28838 细节
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蛋白酶体β亚基7 Q99436 细节
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核受体共激活剂5 Q9HCD5 细节
Hydroxymethylglutaryl-CoA合酶,胞质 Q01581 细节
Geranylgeranyl转移酶2型β亚基 P53611 细节
细胞周期蛋白依赖性激酶16 Q00536 细节
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丝氨酸/ threonine-protein激酶26 Q9P289 细节
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Destrin P60981 细节
Cofilin-1 P23528 细节
Rho-associated蛋白激酶2 O75116 细节
Actin-related 2/3复杂蛋白质亚基1 b O15143 细节
核糖体蛋白S6激酶alpha - Q15418 细节
延长因子2 P13639 细节
酪氨酸受体激酶林恩 P07948 细节
SRSF蛋白激酶2 P78362 细节
Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1 P30419 细节
Afadin P55196 细节
Interleukin-1 receptor-associated激酶4 Q9NWZ3 细节
CREB-binding蛋白质 Q92793 细节
中介的RNA聚合酶II转录单元1 Q15648 细节
钙/ calmodulin-dependent蛋白激酶II型亚基γ Q13555 细节
母亲反对decapentaplegic同族体2 Q15796 细节
蛋白质精氨酸N-methyltransferase 3 O60678 细节
Epsin-1 Q9Y6I3 细节
磷酸甘油酸酯激酶1 P00558 细节
Phosphoglucomutase-1 P36871 细节
波形蛋白 P08670 细节
尿苷5 '一磷酸合酶 P11172 细节
Acyl-CoA-binding蛋白质 P07108 细节
Ras-related蛋白质Rab-7a P51149 细节
Aconitate水合酶、线粒体 Q99798 细节
保利(A)聚合酶α P51003 细节
6-pyruvoyl四氢生物蝶呤合酶 Q03393 细节
肌醇1 4 5-trisphosphate受体1型 Q14643 细节
非常规myosin-Ie Q12965 细节
Gamma-enolase P09104 细节
14-3-3蛋白ε P62258 细节
[3-methyl-2-oxobutanoate脱氢酶[lipoamide]]激酶,线粒体 O14874 细节
过渡内质网腺苷三磷酸酶 P55072 细节
Ubiquitin-like modifier-activating酶1 P22314 细节
排序nexin-3 O60493 细节
瑞士/ SNF-related矩阵actin-dependent调节器的染色质亚科5一员 O60264 细节
Uridine-cytidine kinase-like 1 Q9NWZ5 细节
血影蛋白β链,non-erythrocytic 1 Q01082 细节
剪接体RNA解旋酶DDX39B Q13838 细节
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核糖体蛋白S6激酶alpha 4 O75676 细节
Kinesin-like蛋白质KIF2C Q99661 细节
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肝细胞生长factor-regulated酪氨酸激酶衬底 O14964 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO2 Q9UL54 细节
ADP-ribosylation因子蛋白3 P36405 细节
Peroxiredoxin-6 P30041 细节
碳酸氢钠转运蛋白3 Q9Y6M7 细节
Myc原癌基因蛋白 P01106 细节
Equilibrative核苷转运蛋白2 Q14542 细节
叶酸转运体1 P41440 细节
双特异性增殖蛋白激酶激酶2 P36507 细节
增殖蛋白激酶激酶激酶2 Q9Y2U5 细节
转铁蛋白受体蛋白1 P02786 细节
核糖体蛋白S6激酶alpha 3 P51812 细节
膜相关组件1孕激素受体 O00264 细节
肌醇1,4,5-trisphosphate受体类型3 Q14573 细节
循环AMP-dependent ATF-1转录因子 P18846 细节
循环AMP-dependent ATF-2转录因子 P15336 细节
循环AMP-dependent ATF-4转录因子 P18848 细节
细胞内蛋白质hyaluronan-binding 4 Q5JVS0 细节
组蛋白H1.4 P10412 细节
酪蛋白激酶ⅱβ亚基 P67870 细节
增殖蛋白激酶激酶激酶MLT Q9NYL2 细节
Dihydropyrimidinase-related蛋白2 Q16555 细节
Alpha-enolase P06733 细节
PML蛋白 P29590 细节
核仁的和coiled-body磷蛋白质1 Q14978 细节
TGF-beta-activated激酶1和MAP3K7-binding蛋白质1 Q15750 细节
蛋白质O-GlcNAcase O60502 细节
拉到 P46939 细节
Proprotein转化酶枯草杆菌蛋白酶/可馨类型9 Q8NBP7 细节
Sodium-dependent磷酸盐转运蛋白2 Q08357 细节
Translationally-controlled肿瘤蛋白质 P13693 细节
Nucleobindin-2 P80303 细节
蛋白质S100-A16 Q96FQ6 细节
60 kDa热休克蛋白、线粒体 P10809 细节
40年代核糖体蛋白S2 P15880 细节
异构核核糖核蛋白A2 / B1 P22626 细节
异构核核糖核蛋白H P31943 细节
异构核核糖核蛋白H3 P31942 细节
异构核L核糖核蛋白 P14866 细节
剪接因子,脯氨酸和多 P23246 细节
Stress-induced-phosphoprotein 1 P31948 细节
真核翻译起始因子6 P56537 细节
Hepatoma-derived生长因子 P51858 细节
磷酸甘油酸酯变位酶1 P18669 细节
Ran-specific GTPase-activating蛋白质 P43487 细节
蛋白质S100-A9 P06702 细节
杭丁顿蛋白 P42858 细节
Cap-specific mRNA (nucleoside-2 ' - o -甲基转移酶1 Q8N1G2 细节
神经细胞粘附分子L1 P32004 细节
皮瓣核酸内切酶1 P39748 细节
真核翻译起始因子3单元F O00303 细节
异构核核糖核蛋白F P52597 细节
异构核核糖核蛋白K P61978 细节
10 kDa热休克蛋白、线粒体 P61604 细节
热休克蛋白105 kDa Q92598 细节
核迁移蛋白质nudC Q9Y266 细节
26 s蛋白酶调节亚基6 P17980 细节
瑞士/ SNF-related矩阵actin-dependent调节器的染色质亚科1 E成员 Q969G3 细节
肿瘤蛋白质D54 O43399 细节
泛素羧基末端水解酶14 P54578 细节
14-3-3蛋白θ P27348 细节
Chromobox蛋白质同族体5 P45973 细节
角蛋白,II型细胞骨架1 P04264 细节
Desmoplakin P15924 细节
Hornerin Q86YZ3 细节
结plakoglobin P14923 细节
目前上游元件结合蛋白2 Q92945 细节
半胱氨酸和glycine-rich蛋白质1 P21291 细节
Filamin-A P21333 细节
异构核核糖核蛋白D0 Q14103 细节
异染色质蛋白质1-binding 3 Q5SSJ5 细节
Ras GTPase-activating-like蛋白质IQGAP1 P46940 细节
Nucleophosmin P06748 细节
60年代L14核糖体蛋白质 P50914 细节
60年代核糖体蛋白就是 Q07020 细节
60年代核糖体蛋白L4 P36578 细节
40年代核糖体蛋白肌力 P08708 细节
40年代核糖体蛋白S6 P62753 细节
剪接因子1 Q15637 细节
小型核核糖核蛋白Sm D2 P62316 细节
丝氨酸/ arginine-rich剪接因子4 Q08170 细节
Transgelin-2 P37802 细节
Zyxin Q15942 细节
丝氨酸/ arginine-rich剪接因子1 Q07955 细节
生存运动神经元蛋白质 B4DP61 细节
Myosin-9 P35579 细节
可能ATP-dependent RNA解旋酶DDX5 P17844 细节
剪接因子3 b亚基1 O75533 细节
伸长的长链脂肪酸蛋白5 Q9NYP7 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶24 Q9Y6E0 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶38 Q15208 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶38-like Q9Y2H1 细节
STE20 / SPS1-related proline-alanine-rich蛋白激酶 Q9UEW8 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶TAO3 Q9H2K8 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶tousled-like 1 Q9UKI8 细节
Non-receptor酪氨酸受体激酶TNK1 Q13470 细节
丝氨酸/ threonine-protein激酶ULK1 O75385 细节
AP2-associated蛋白激酶1 Q2M2I8 细节
BMP-2-inducible蛋白激酶 Q9NSY1 细节
钙/ calmodulin-dependent蛋白激酶激酶1 Q8N5S9 细节
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锌转运蛋白5 Q8TAD4 细节
锌转运体zip2 Q9BRY0 细节
酪氨酸受体磷酸酶non-receptor类型12 Q05209 细节
v型质子atp酶116 kDa单元同种型4 Q9HBG4 细节
Caspase-4 P49662 细节
质膜calcium-transporting腺苷三磷酸酶1 P20020 细节
Caspase-9 P55211 细节
DNA甲基转移酶3 b (cytosine-5) Q9UBC3 细节
白细胞介素- 6受体β亚基 P40189 细节
Molybdopterin合酶催化亚基 O96007 细节
受体酪氨酸蛋白激酶 Q504U8 细节
Microphthalmia-associated转录因子 O75030 细节
真核翻译起始因子4 e结合蛋白1 Q13541 细节
Lysine-specific组蛋白demethylase 1 O60341 细节
信号传感器和转录激活1α/β P42224 细节
ki - 67增殖标记蛋白质 P46013 细节
ELAV-like蛋白1 Q15717 细节
核转录因子2红细胞两个相关因素 Q16236 细节
双特异性增殖蛋白激酶激酶4 P45985 细节
腺苷酸环化酶类型9 O60503 细节