分:一个医药目标导引头。
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刘丁P,燕X, Z, Du J, Du Y, Y,吴D,徐Y,周H,徐顾Q, J
分:一个医药目标导引头。
数据库(牛津大学)。2017年1月1;2017年。pii: 4781737。doi: 10.1093 /数据库/ bax095。
- PubMed ID
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31725865 (在PubMed]
- 文摘
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目标识别蛋白质生物活性化合物在药物发现是至关重要的。鱼药靶的分子相似性是一种主要的方法,是基于一个公理,类似的化合物可能有相同的目标。分子结构相似的化合物和一个已知的目标可以被衡量的配体拓扑(2 d),立体(3 d)或静态(pharmacophoric)指标。网络拓扑度量是快,但不能代表一种生物活性化合物的空间和静态配置文件。空间和静态指标反映一种化合物的形状属性如果实验获得了其结构,并可能是不可靠的,如果他们是基于假定的构象的数据。在这篇文章中,我们报告一个制药目标导引头(PTS),搜索蛋白质生物活性化合物的目标基于静态和立体形状比较通过比较复合结构对实验配体结构。特别是活性化合物的晶体结构被纳入相似性计算和预测目标阈值可以根据筛选多活动。分制药目标数据库,其中包含大约250 000配体带注释的蛋白质约有2300的目标。beplayapp为用户提供了一个可视化工具来检查结果。数据库的URL: http://www.rcdd.org.cn/PTS。