蛋白酶体抑制剂的化学模式:二十年药物设计的经验教训。
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Guedes RA, Aniceto N, Andrade MAP, Salvador JAR, Guedes RC
蛋白酶体抑制剂的化学模式:二十年药物设计的经验教训。
国际医学杂志。2019 Oct 25;20(21)。pii: ijms20215326。doi: 10.3390 / ijms20215326。
- PubMed ID
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31731563 (PubMed视图］
- 摘要
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药物发现现在面临着一个新的挑战，实验数据的可用性不再是限制步骤，相反，在化学信息学和生物信息学方法广泛纳入药物发现和开发管道的推动下，数据的意义已经获得了一个新的重要水平。例如，这使得结构-活性关系的推断在发现新的候选药物时非常有用。考虑到在过去的20年中已经设计和测试了多种化合物，并且这些数据收集尚未进行此类评估，因此可以从这种类型的数据挖掘中受益的治疗应用之一是蛋白酶体抑制。本研究回顾了二十年来蛋白酶体抑制剂的发展(680种化合物)，以收集可以从中学到的东西，并将这些知识应用于该主题的任何未来药物发现。我们的分析集中在如何使用不同的化学描述符和统计工具来提取有趣的活动模式。在该数据集中观察到结构-活性关系的多个实例，无论是孤立的分子描述符(例如，分子折射率和拓扑极性表面积)，还是支架相似性或化学空间重叠。构建决策树可以识别两个有意义的决策规则，这些规则描述了与高活性相关的化学参数。此外，对关键官能团的普遍性的描述，可以洞察药物发现项目所遵循的全球模式，并突出了化学空间中一些系统地未被探索的部分。所确定的各种化学模式提供了有用的见解，可以应用于未来的药物发现项目，并概述了迄今为止所做的工作。
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