腺苷受体负责的生物物理映射。

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茹科夫,安德鲁斯SP, Errey JC,罗伯逊N, Tehan B,梅森JS,马歇尔FH堰M,康格里夫M

腺苷受体负责的生物物理映射。

J地中海化学。2011年7月14日,54(13):4312 - 23所示。doi: 10.1021 / jm2003798。Epub 2011 6月10。

PubMed ID
21661720 (在PubMed
]
文摘

新方法生成绑定口袋内的配体受体相互作用信息G protein-coupled受体已经被开发出来,称为生物物理映射(BPM)。从稳定受体(明星),最低限度工程热稳定性,然后添加在附加单突变位置,可以与小分子的相互作用有关。的明星和一个面板结合位点突变体捕获到Biacore芯片,使描述小分子配体的结合使用表面等离子体共振(SPR)测量。矩阵的一组绑定数据配体与每一个活性位点突变然后生成,提供特定的亲和力和动力学信息(K (D)、K(上)和K())的receptor-ligand交互。这个数据集,结合分子建模和对接,用于地图的每个类小分子结合位点的化合物。综上所述,这些数据提供的许多约束识别关键protein-ligand交互和允许网站的形状精制生产高质量的三维图片配体绑定,从而促进基于结构的药物设计。生物物理映射结果的腺苷(2 A)受体。

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绑定属性
药物 目标 财产 测量 pH值 温度(°C)
4 - {2 - [(7-amino-2-furan-2-yl (1、2、4) triazolo (1、5) [1、3、5] triazin-5-yl)氨基)乙基}苯酚 腺苷受体负责 Ki (nM) 2 N /一个 N /一个 细节
咖啡因 腺苷受体负责 Ki (nM) 5011.87 N /一个 N /一个 细节
茶碱 腺苷受体负责 Ki (nM) > 10000 N /一个 N /一个 细节