四种人类胶原蛋白基因在不同种族人群中的自然变异。
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陈tf, Poon A, Basu A, Addleman NR，陈j, Phong A, Byers PH, Klein TE, Kwok PY
四种人类胶原蛋白基因在不同种族人群中的自然变异。
基因组学，2008年4月;91(4):307-14。doi: 10.1016 / j.ygeno.2007.12.008。Epub 2008年2月12日。
- PubMed ID
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18272325 (PubMed视图]
- 摘要
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胶原蛋白是高等生物中最重要的结构蛋白家族之一。人类有43个基因编码的28种胶原蛋白，它们分为几种不同的功能蛋白类。主要纤维胶原蛋白基因突变导致成骨不全(编码I型胶原蛋白链的COL1A1和COL1A2)、软骨发育不良(编码II型胶原蛋白链的COL2A1)和血管Ehlers-Danlos综合征(编码III型胶原蛋白链的COL3A1)。在过去的20年里，这些胶原蛋白基因的突变已经被编目，希望了解由这些突变引起的疾病的分子病因学，描述基因型-表型关系，并开发预测分子和临床结果的可靠模型。为了更好地实现这些目标，有必要了解人类胶原蛋白基因的自然变异模式。我们筛选了来自四个不同种族人群的48个个体的COL1A1、COL1A2、COL2A1和COL3A1变异的外显子、内含子侧边区域和保守的非编码区域。我们鉴定了459个单核苷酸多态性(SNPs)，其中一半以上是新的，在公共数据库中没有发现。在编码区发现的52个snp中，15个引起氨基酸取代，37个没有。虽然这四种胶原蛋白具有相似的基因和蛋白质结构，但它们具有不同的分子进化特征。例如，COL1A1似乎受到了比其他基因强得多的负选择。 Phylogenetic analysis also suggests that the four genes have very different evolutionary histories among the different ethnic groups. Our observations suggest that the study of collagen mutations and their relationships with disease phenotypes should be performed in the context of the genetic background of the subjects.