分泌蛋白发现计划(SPDI)，一项大规模的努力，以确定新的人类分泌蛋白和跨膜蛋白:生物信息学评估。

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分泌蛋白发现计划(SPDI)，一项大规模的努力，以确定新的人类分泌蛋白和跨膜蛋白:生物信息学评估。

基因组学报，2003年10月;13(10):2265-70。Epub 2003 9月15日。

PubMed ID
12975309 (PubMed视图
]
摘要

一项被称为分泌蛋白发现计划(SPDI)的大规模努力被用于鉴定新的分泌蛋白和跨膜蛋白。在几种方法中的第一种，酵母细胞中的生物信号序列陷阱被用来识别编码假定分泌蛋白的cDNA克隆。第二种策略利用各种识别特征的算法，如信号序列的疏水特性，以识别由人类cDNA文库中的表达序列标签(est)编码的假定蛋白质。第三种方法是利用BLAST算法调查est与一组已知受体及其配体的蛋白质序列相似性。最后，利用信号序列预测算法和BLAST方法从人类基因组序列中识别潜在基因的单外显子。这些候选基因的全长cDNA克隆的分离导致了>1000个新蛋白质的鉴定。根据最新的GenBank版本，总共有256个这些cdna仍然是新的，包括变体和新基因。通过预测蛋白质结构域、亚细胞定位和可能的功能作用，对蛋白质进行生物信息学分析，评估了这一大规模工作的成功。SPDI集合将有助于更好地理解细胞间通信，可能导致对人类疾病的新理解，并为治疗方法的发展提供潜在的机会。

beplay体育安全吗引用本文的药物库数据

多肽
名字 UniProt ID
脱氢酶/还原酶SDR家族成员 Q9BTZ2 细节
toll样受体7 Q9NYK1 细节
3-keto-steroid还原酶 P56937 细节
蛋白质amnionless Q9BXJ7 细节
血清白蛋白 P02768 细节
精胺氧化酶 Q9NWM0 细节
视黄醇脱氢酶13 Q8NBN7 细节
维生素K环氧还原酶复合亚基1 Q9BQB6 细节
血管紧张素转换酶2 Q9BYF1 细节
肿瘤坏死因子配体超家族成员13B Q9Y275 细节
toll样受体9 Q9NR96 细节
内质网甘露糖寡糖1,2-甘露糖苷酶 Q9UKM7 细节
硫酸肝素葡萄糖胺3- o -磺基转移酶3A1 Q9Y663 细节
组织蛋白酶L2 O60911 细节
adp核糖焦磷酸酶，线粒体 Q9BW91 细节
蛋氨酸腺苷转移酶2亚基β Q9NZL9 细节
胆碱转运体样蛋白4 Q53GD3 细节
胆碱转运体样蛋白3 Q8N4M1 细节
脯氨酸4-羟化酶亚基α -2 O15460 细节
beta 1, 4-galactosyltransferase 4 O60513 细节
硫氧还蛋白结构域蛋白12 O95881 细节
可能是谷胱甘肽过氧化物酶8 Q8TED1 细节
谷胱甘肽过氧化物酶 Q96SL4 细节
短链脱氢酶/还原酶 O75911 细节
14-reductase All-trans-retinol 13日 Q6NUM9 细节
视黄醇脱氢酶14 Q9HBH5 细节
雌二醇17- β脱氢酶11 Q8NBQ5 细节
脱氢酶/还原酶SDR家族成员 Q6UWP2 细节
Phosphopantothenoylcysteine脱羧酶 Q96CD2 细节
γ -分泌酶亚单位APH-1A Q96BI3 细节
血小板衍生生长因子D Q9GZP0 细节
白细胞介素23亚单位 Q9NPF7 细节
肿瘤坏死因子受体超家族成员10B O14763 细节
前列腺干细胞抗原 O43653 细节
跨膜糖蛋白NMB Q14956 细节
SLAM家庭成员7 Q9NQ25 细节
toll样受体8 Q9NR97 细节
碳酸酐酶相关蛋白10 Q9NS85 细节
碳酸酐酶相关蛋白11 O75493 细节
碳酸酐酶14 Q9ULX7 细节
钠通道亚单位β -2 O60939 细节
矩阵metalloproteinase-27 Q9H306 细节
矩阵metalloproteinase-28 Q9H239 细节
Pannexin-1 Q96RD7 细节
维甲酸诱导的丝氨酸羧肽酶 Q9HB40 细节
Lactase-like蛋白质 Q6UWM7 细节
nadh细胞色素b5还原酶 Q9UHQ9 细节
丝氨酸蛋白酶抑制剂kazal - 6型 Q6UWN8 细节
L-amino-acid氧化酶 Q96RQ9 细节
邻苯二酚o -甲基转移酶结构域蛋白1 Q86VU5 细节
Lactosylceramideα2,3-sialyltransferase Q9UNP4 细节
N-acetylmuramoyl-L-alanine酰胺酶 Q96PD5 细节
丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶TAO2 Q9UL54 细节
一种具有血栓反应蛋白基序的分解素和金属蛋白酶 O75173 细节
细胞色素P450 4F12 Q9HCS2 细节
溶质载体家族22个成员12个 Q96S37 细节
透明质酸和蛋白聚糖连接蛋白3 Q96S86 细节
Layilin Q6UX15 细节
c型凝集素结构域家族14个成员A Q86T13 细节
成纤维细胞生长因子19 O95750 细节
Hephaestin Q9BQS7 细节
Peflin Q9UBV8 细节
二酰基甘油o酰基转移酶2 Q96PD7 细节
蛋白质RIC-3 Q7Z5B4 细节
Tachykinin-3 Q9UHF0 细节
c型凝集素结构域家族4成员E Q9ULY5 细节
一种具有血栓反应蛋白基序的分解素和金属蛋白酶 Q76LX8 细节
受体相互作用丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶2 O43353 细节
Sclerostin Q9BQB4 细节
Hepcidin P81172 细节
视黄醇摄取受体STRA6 Q9BX79 细节
锌转运体5 Q8TAD4 细节
锌转运蛋白ZIP9 Q9NUM3 细节
血管生成素相关蛋白3 Q9Y5C1 细节
平衡核苷转运体3 Q9BZD2 细节
淋巴管内皮透明质酸受体1 Q9Y5Y7 细节
二肽酶3 Q9H4B8 细节
小鼠抗原 Q5ZPR3 细节