ATM和ATR衬底分析显示广泛的蛋白质网络响应DNA损伤。
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松岗,Ballif英航,Smogorzewska麦当劳ER 3日Hurov KE,罗J, Bakalarski CE、赵Z, Solimini N, Lerenthal Y, Y示罗,埃里奇那本怀特SJ Gygi SP
ATM和ATR衬底分析显示广泛的蛋白质网络响应DNA损伤。
科学。2007年5月25日,316 (5828):1160 - 6。
- PubMed ID
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17525332 (在PubMed]
- 文摘
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细胞对DNA损伤的反应是由蛋白激酶,包括ATM(共济失调毛细血管扩张突变)和ATR (ATM和Rad3-related)。这个途径的信号转导部分的轮廓是已知的,但对DNA损伤反应的生理范围(DDR)。beplayapp我们进行了大规模的蛋白质磷酸化蛋白质组分析应对DNA损伤共识网站被ATM和ATR和识别出了900多个监管包括超过700个蛋白质磷酸化网站。这个数据集的一个子集的功能分析表明,这个列表是蛋白质参与DDR高纯度。这组蛋白质高度相互关联,我们发现了大量的蛋白质未链接到DDR模块和网络。这个数据库描绘DDR比以前的更广泛的景观欣赏和打开新途径调查哺乳动物的DNA损伤反应。
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- 多肽
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的名字 UniProt ID 英国皇家空军原癌基因丝氨酸/ threonine-protein激酶 P04049 细节 丝氨酸- tRNA连接酶,胞质 P49591 细节 Abelson酪氨酸受体激酶2 P42684 细节 β2肾上腺素能受体 P07550 细节 /钠氢交换器1 P19634 细节 循环AMP-responsive元件结合蛋白1 P16220 细节 增殖蛋白激酶14 Q16539 细节 Deoxyhypusine合酶 P49366 细节 Microtubule-associated蛋白1 P78559 细节 保利(ADP-ribose)聚合酶1 P09874 细节 Kinesin-like蛋白质KIF11 P52732 细节 热休克蛋白HSP 90 -β P08238 细节 Peptidyl-prolyl顺反异构酶G Q13427 细节 依赖dna的蛋白激酶催化亚基 P78527 细节 DNA拓扑异构酶2β Q02880 细节 可能ATP-dependent RNA解旋酶DDX6 P26196 细节 C-terminal-binding蛋白1 Q13363 细节 脱氧胞苷激酶 P27707 细节 细胞p53肿瘤抗原 P04637 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶Chk1 O14757 细节 淋巴球抗原CD19 P15391 细节 DNA聚合酶催化亚基ε Q07864 细节 DNA聚合酶ε4单元 Q9NR33 细节 核受体共激活剂1 Q15788 细节 Peptidyl-prolyl顺反异构酶NIMA-interacting 1 Q13526 细节 热休克蛋白质同源71 kDa P11142 细节 CREB-binding蛋白质 Q92793 细节 中介的RNA聚合酶II转录单元1 Q15648 细节 过渡内质网腺苷三磷酸酶 P55072 细节 Kinesin-like蛋白质KIF2C Q99661 细节 丝氨酸即激酶ATM Q13315 细节 异构核核糖核蛋白F P52597 细节 70 kDa热休克蛋白4 P34932 细节 目前上游元件结合蛋白2 Q92945 细节 异染色质蛋白质1-binding 3 Q5SSJ5 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶LATS1 O95835 细节 丝氨酸/ threonine-protein激酶OSR1 O95747 细节 v型质子atp酶116 kDa单元同种型2 Q9Y487 细节 真核翻译起始因子4 e结合蛋白1 Q13541 细节