体外选择分析新霉素绑定rna与诱变处理池变异的16 s rRNA解码。

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Famulok M, Huttenhofer

体外选择分析新霉素绑定rna与诱变处理池变异的16 s rRNA解码。

生物化学。1996年4月9日,35 (14):4265 - 70。

PubMed ID

8605174 (在PubMed

]

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新霉素的体外选择B进行了绑定的RNA池包含47-nucleotide域的解码地区16 s rrna,变异在30%基础位置。退化地区是由一个寡核苷酸类似物(“主题”)解码地区的30年代的子单元中曾被证明与氨基糖苷类抗生素新霉素B和tRNA配体。经过五周期的选择/放大,RNA序列被孤立,特别是新霉素b .克隆和测序表明没有一个孤立的克隆共享主序列或二级结构同源性的解码地区16 s RNA。相反的,一套新的序列是孤立的,可以折叠成一个发夹结构定义为主题我们调查主题的亲和力,主题B,没有选择池RNA,和相应的unmutagenized“父”RNA新霉素B在不同Mg2 +浓度。缓冲条件下的低离子强度所有rna测试必然是非新霉素B .然而,主题必将新霉素B Mg2 +浓度的绑定的其他rna是否显著降低检测测试。这是符合主题B表现出更高的亲和力比主题新霉素B在这些条件下。主题B曾被孤立的体外选择识别RNA序列与亲和力新霉素B使用一个完全随机的RNA池共享没有关系主题答:我们的研究结果表明,主题B可能代表一个高度优化的RNA序列对新霉素B绑定;相反,16 s rRNA的网站主题(主题)可能不是最优目标新霉素B的认可。

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药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
新霉素b	30年代S12核糖体蛋白质	蛋白质	大肠杆菌(应变K12)	是的	抑制剂	细节