验证模型的细胞色素P450 2 d6:一个在网上工具预测代谢和抑制。

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坎普钙、弗拉纳根JU,范Eldik AJ, Marechal JD,狼CR,罗伯茨GC,潘恩MJ, Sutcliffe乔丹

验证模型的细胞色素P450 2 d6:一个在网上工具预测代谢和抑制。

J地中海化学。2004年10月21日,47 (22):5340 - 6。

PubMed ID
15481972 (在PubMed
]
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有很多兴趣的发展预测模型的细胞色素P450 2 d6尤其是因为这种酶是参与至少50药物的氧化。之前我们已经描述了同源性建模和分子对接的结合使用正确位置的一系列基质CYP2D6的活性部位与已知的网站上面代谢血红素。在这里,我们的方法识别正确的非典型代谢(没有基本的氮)细胞色素P450 2 d6衬底,spirosulfonamide。同样的方法用于屏幕小细胞色素P450 2 d6抑制化合物数据库。数据库包含33个化合物从国家癌症研究所数据库是停靠到我们的细胞色素P450 2 d6使用程序GOLDv2.0同源模型。实验为33化合物测定IC50值;与相应的停靠分数显示相关的回归系数r2 = 0.61 (q2 = 0.59)。方法能够正确区分紧和弱结合的化合物和识别几个小说抑制剂。因此结果表明我们的方法,结合了同源性建模和分子对接,产生了一个有用的预测在硅抑制细胞色素P450 2 d6的工具,这是最好的作为一个过滤器multifilter数据库的屏幕。

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绑定属性
药物 目标 财产 测量 pH值 温度(°C)
去甲替林 细胞色素P450 2 d6 集成电路50 (nM) 2600年 N /一个 N /一个 细节
奎尼丁 细胞色素P450 2 d6 集成电路50 (nM) 10 N /一个 N /一个 细节
奎尼丁 细胞色素P450 2 d6 Ki (nM) 30. N /一个 N /一个 细节
育亨宾 细胞色素P450 2 d6 Ki (nM) 180年 N /一个 N /一个 细节
育亨宾 细胞色素P450 2 d6 集成电路50 (nM) 8.4 N /一个 N /一个 细节