合理的设计结合活性激酶抑制剂的构象。

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刘Y,灰色NS

合理的设计结合活性激酶抑制剂的构象。

Nat化学杂志。2006;2 (7):358 - 64。

PubMed ID

16783341 (在PubMed

]

文摘

大多数的激酶抑制剂开发迄今为止——被称为I型抑制剂——目标的ATP结合位点的激酶活性构象,激活循环的磷酸化。最近,晶体结构等抑制剂伊马替尼(STI571) BIRB796和索拉非尼(bay43 - 9006)——被称为II型抑制剂——揭示了一个新的绑定模式,利用额外的结合位点立即毗邻地区被ATP。这个口袋是可以由一个活化环重排的激酶活性构象特征。在这里,我们提出一个绑定模式的结构分析已知的人类II型抑制剂和证明他们符合一个药效团模型,目前被用于设计新一代的激酶抑制剂。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
(1)- 5-Tert-Butyl-2-Methyl-2h-Pyrazol-3-Yl 3 - (4-Chloro-Phenyl)尿素	增殖蛋白激酶14	Kd (nM)	1160年	N /一个	N /一个	细节
3-FLUORO-5-MORPHOLIN-4-YL-N - [1 - (2-PYRIDIN-4-YLETHYL) 1 h-indol-6-yl]苯甲酰胺	增殖蛋白激酶14	集成电路50 (nM)	340年	N /一个	N /一个	细节
伊马替尼	血小板源生长因子受体β	集成电路50 (nM)	386年	N /一个	N /一个	细节
伊马替尼	酪氨酸受体激酶ABL1	Ki (nM)	37	N /一个	N /一个	细节
伊马替尼	酪氨酸受体激酶ABL1	Ki (nM)	7000年	N /一个	N /一个	细节
伊马替尼	酪氨酸受体激酶ABL1	集成电路50 (nM)	188年	N /一个	N /一个	细节
索拉非尼	纤维母细胞生长因子受体1	集成电路50 (nM)	580年	N /一个	N /一个	细节
索拉非尼	血小板源生长因子受体β	集成电路50 (nM)	57	N /一个	N /一个	细节
索拉非尼	FLT3 Receptor-type酪氨酸受体激酶	集成电路50 (nM)	58	N /一个	N /一个	细节
索拉非尼	丝氨酸/ threonine-protein激酶b - raf	集成电路50 (nM)	22	N /一个	N /一个	细节
索拉非尼	血管内皮生长因子受体2	集成电路50 (nM)	90年	N /一个	N /一个	细节