purinergic P2Y12受体的分子建模和交互的拮抗剂。

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詹C,杨J,王董XC,黄

purinergic P2Y12受体的分子建模和交互的拮抗剂。

J摩尔图模型。2007年7月,26 (1):20-31。Epub 2006年9月26日。

PubMed ID

17110146 (在PubMed

]

文摘

Purinergic为嘌呤受体是细胞表面受体的类,喜欢ATP和ADP腺苷。表面的受体细胞外核苷酸被称为P2受体。他们通过嘧啶和嘌呤核苷酸被激活。ADP启动血小板聚集的“同时激活两个G protein-coupled受体,P2Y1 P2Y12。P2Y12的目标已被证明是thienopyridine药物,ticlopidine和氯吡格雷。这里,活跃的站点P2Y12 ATP和ADP由生物信息学和分子建模预测。首先,P2Y12的三维(3 d)结构是由InsightII /同源模块使用相应的牛视紫红质(PDB代码:1 hzx)作为模板。然后由能量最小化的主要结构进行了优化,已成功接受的蛋白质数据库(PDB代码:1 vz1)。第二,一个简单的评分矩阵分析的基础上建立了13个已知腺苷结合蛋白质。和最可能的活性位点P2Y12预测使用得分矩阵,其中包括三个遥远的领域:“头区”(LGTGPLRTFV, 87 - 96),“中间领域”(VGLITNGLAM、38-47 LGAKILSVVI, 139 - 148年),和“底区”(RTRGVGKVPR, 222 - 231)。 Subsequently the structural model of P2Y12 was docked with ATP/ADP in comparison with P2Y1 (PDB code 1ddd). As a comparison, we docked its antagonists, such as ticlopidine and clopidogrel, to the most probable sites and calculated their intermolecular energy. Our results imply that P2Y12 has the potential to be inhibited by ADP/ATP analogs, and it suggests that P2Y12 acts as a target of new drugs that inhibit platelet aggregation.

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药物靶点

药物	目标	类	生物	药理作用	行动
Ticlopidine	P2Y purinoceptor 12	蛋白质	人类	是的	拮抗剂	细节