两个同源的hERG K +通道模型:应用程序来配体结合。

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李Rajamani R, Tounge BA, J,雷诺兹CH

两个同源的hERG K +通道模型:应用程序来配体结合。

地中海Bioorg化学。2005年3月15日,15 (6):1737 - 41。

PubMed ID

15745831 (在PubMed

]

文摘

同源模型根据可用的K +通道结构被用来构造一个hERG心脏的多个状态表示K +通道。这些国家是用来捕获通道的灵活性。我们表明,这种灵活性是重要的为了正确模型绑定一组不同的配体的亲和力。使用这种多个状态方法,已知一组绑定关联模型构造的hERG通道绑定。预测pIC50s在良好的协议与实验(RMSD: 0.56千卡每摩尔)。此外,这些计算提供结合配体的结构符合出版突变研究。这些配体结合计算复杂的结构可以用于指导合成类似物与hERG减少责任。

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绑定属性

药物	目标	财产	测量	pH值	温度(°C)
阿司咪唑	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	0.91	N /一个	N /一个	细节
Bepridil	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	550年	N /一个	N /一个	细节
氯丙嗪	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	1479年	N /一个	N /一个	细节
Cisapride	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	6.5	N /一个	N /一个	细节
Halofantrine	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	200年	N /一个	N /一个	细节
丙咪嗪	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	3388年	N /一个	N /一个	细节
Perhexiline	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	7762年	N /一个	N /一个	细节
号使用	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	18	N /一个	N /一个	细节
Sertindole	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	14	N /一个	N /一个	细节
Terfenadine	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	129年	N /一个	N /一个	细节
甲硫哒嗪	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	35	N /一个	N /一个	细节
维拉帕米	电压门控钾通道亚科2 H成员	集成电路50 (nM)	145年	N /一个	N /一个	细节