更新的类固醇基准集及其在发现性激素结合球蛋白的新型纳米摩尔配体中的应用。
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引用
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Cherkasov A, Ban F, Santos-Filho O, Thorsteinson N, Fallahi M, Hammond GL
更新的类固醇基准集及其在发现性激素结合球蛋白的新型纳米摩尔配体中的应用。
中华医学化学杂志2008年4月10日;51(7):2047-56。doi: 10.1021 / jm7011485。Epub 2008 3月11日。
- PubMed ID
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18330978 (PubMed视图]
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已知与性激素结合球蛋白(SHBG)亲和的类固醇基准数据集已被广泛用于验证流行的基于分子场的QSAR技术。我们通过添加一些非甾体SHBG配体来扩展数据集,这些配体都是从文献和我们之前的实验研究中识别出来的。此更新的分子集已用于开发基于“诱导”描述符的4D QSAR模型,并深入了解蛋白质-配体相互作用的分子基础。分子定位是通过将活性化合物对接到SHBG的活性位点来实现的。令人惊讶的是,基准类固醇的对齐与之前CoMFA和CoMSIA模型中使用的经典配体对齐相矛盾,但提供了更高的统计显著性和预测能力。由此得到的QSAR模型结合CoMFA和CoMSiA模型以及基于结构的虚拟筛选,可以发现几种低微摩尔到纳摩尔的人类SHBG非甾体抑制剂。
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药物 目标 财产 测量 pH值 温度(°C) 2-Methoxyestradiol 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 0.832 N/A N/A 细节 达那唑 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 6.3 N/A N/A 细节 雌二醇 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 1.5 N/A N/A 细节 雌三醇 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 234 N/A N/A 细节 雌激素酮 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 6.6 N/A N/A 细节 染料木黄酮 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 39811 N/A N/A 细节 氢化可的松 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 631 N/A N/A 细节 Levonorgestrel 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 1.2 N/A N/A 细节 Methyltestosterone 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 3.7 N/A N/A 细节 柚苷配基 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 955 N/A N/A 细节 柚苷配基 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 28184 N/A N/A 细节 Norethisterone 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 11 N/A N/A 细节 孕酮 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 115 N/A N/A 细节 Stanolone 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 0.182 N/A N/A 细节 睾酮 性激素结合球蛋白 Kd (nM) 0.631 N/A N/A 细节